Легко заметить, что многие сети естественным образом делятся на сообщества или модули, где связи внутри модулей сильнее и плотнее, чем между модулями – например, как люди из одной возрастной группы, как правило, больше взаимодействуют друг с другом, чем с людьми разного возраста. группы. Широко распространено мнение, что сети внутри ячеек являются модульными во многом таким же образом. Доктора Чжи Ван и Цзянджи Чжан из Мичиганского университета теперь исследуют эти модульные свойства и приходят к выводу, что они могут быть лишь случайным побочным продуктом эволюции, а не функциональными.
Считалось, что модули сотовых сетей сформированы таким образом, чтобы отражать относительную независимость и согласованность различных функциональных единиц в ячейке – каждый модуль выполняет определенную функцию. Это исследование, опубликованное в журнале Open Access PLoS Computational Biology, теперь предполагает, что структурные модули в дрожжевой сети взаимодействия белок-белок могли возникнуть как побочный продукт эволюции, не имеющий особого биологического значения.
Существует мало свидетельств того, что ранее наблюдаемые структурные модули каким-либо образом соответствуют функциональным единицам. Похоже, что предыдущие анализы могли даже создать некоторые из этих модулей с помощью методов, используемых для исследования свойств белков. Опровергая предыдущие исследования, авторы теперь показывают с помощью компьютерного моделирования, что модульные структуры могут возникать во время роста сети с помощью простой модели дупликации генов, без предпочтения модульности естественным отбором.
Источник: Публичная научная библиотека