Ученый Кью и соавтор бумаги Джо Паркер говорят; «Это исследование доказывает, что мы можем теперь быстро прочитать последовательность ДНК организма, чтобы отождествить его с минимальным оборудованием. Быстро читающая ДНК где угодно, по желанию, должна стать обычным шагом во многих областях исследования. Несмотря на сотни лет таксономического исследования, все еще не всегда легко удаться, каким разновидностям завод принадлежит только, смотря на него. Немного людей могли правильно определить все разновидности в своих собственных садах».
За прошлые сорок лет упорядочивающая ДНК коренным образом изменила научный мир, но осталась направляющейся лабораторией. Используя текущие методы, полный эксперимент, чтобы определить разновидность, от полевых исследований, чтобы закончиться, мог легко взять ученого месяцы, чтобы закончить. Идентификация разновидностей, по своей природе, в основном полевая область преследования, таким образом ограничивая темп открытия и принятия решения, которое может зависеть от него.
Используя новую технологию, чтобы определить разновидности быстро и локальный очень важно для научного исследования, сохранения биоразнообразия и в борьбе с преступлением разновидностей.В этом новом исследовании ученые Кью использовали портативную программу упорядочения ДНК, MinION от Oxford Nanopore Technologies, чтобы проанализировать виды растений в Национальном парке Сноудонии. Это было первым разом, когда геномное упорядочивание заводов было выполнено в области.Эта технология, коммерчески начатая в 2015, с тех пор использовалась в Антарктиде в отдаленных регионах, затронутых болезнью, и на Международной космической станции.
Один из успехов, иллюстрированных в газете, является полевой идентификацией двух безвредных белых цветов, Arabidopsis thaliana и Arabidopsis lyrata ssp. petraea. Это было достигнуто, упорядочив случайные части геномов заводов, избежав хитрого и трудоемкого процесса планирования для определенных кусков ДНК, которая является более традиционным подходом для идентификации разновидностей с ДНК.Исследователи сравнили свои новые данные с базой данных в свободном доступе справочных последовательностей генома, чтобы сделать их идентификацию.
Кардинально, репликация их эксперимента в Лаборатории Кью Jodrell с другими методами упорядочивающего ДНК позволила им создавать сложную статистику, чтобы понять полезные свойства этого нового вида данных впервые.Александр Пэпэдопулос, ученый Кью и соавтор на бумаге, говорит; «Точная идентификация разновидностей важна для эволюционного и экологического исследования в борьбе с преступлениями против дикой природы и для контроля редкого и исчезающего вида. Идентификация разновидностей правильно на основе того, на что они похожи, может быть действительно хитрой и экспертное знание потребностей, которое преуспеется. Это особенно верно для заводов, когда они не цветут или когда они были обработаны в продукт.
Наши эксперименты показывают, что, упорядочивая случайные части генома в области возможно получить очень точную идентификацию разновидностей в течение нескольких часов после сбора экземпляра. Более традиционные методы нужны в большом количестве оборудования лаборатории и часто только предоставляли достаточно информации, чтобы определить образец к уровню рода».Есть другие полезные свойства их данных также.
Упорядоченные данные этой области могут использоваться, чтобы собрать целую последовательность генома, действовать как справочная база данных для разновидностей, и помощь понимают эволюционные отношения. В настоящее время команда исследует выполнимость быстрого создания справочной базы данных последовательности из невероятно разнообразной коллекции помощи заводов в живущей коллекции и гербарии Кью, а также заявлениях на контроль здоровья растений.