Еще одно исследование добавляет доказательства того, что антибиотики могут нарушить баланс кишечной флоры, что отрицательно сказывается на здоровье. Группа исследователей из Мемориального онкологического центра им. Слоуна Кеттеринга, Нью-Йорк, показала на моделях мышей, что однократная доза широко используемого антибиотика, клиндамицина, уничтожила почти 90 процентов бактериальных таксонов, в результате чего мыши были необычно восприимчивы к инфекции. Clostridium difficile, бактериальный патоген, который безвреден для большинства здоровых людей, но может вызывать тяжелую диарею у людей после лечения антибиотиками. Их исследование опубликовано в январском номере журнала Infection and Immunity.
Уже известно, что клиндамицин «тесно связан с развитием инфекций Clostridium difficile» у людей и мышей, говорит автор-корреспондент Эрик Дж. Памер. В более ранней работе Тревор Лоули показал, что введение клиндамицина приводит к хроническому выделению C. difficile от инфицированных мышей. Исследователи, в число которых входили коллеги Памера Чарли Баффи и Жоао Ксавье, выдвинули гипотезу, что «опосредованное клиндамицином разрушение сложных, но стабильных сетей взаимодействующих и взаимозависимых видов бактерий [в кишечнике] приведет к заметной нестабильности микробиоты», что оставит мышей, уязвимых к инфекции, говорит Пэмер, добавляя: «Наша долгосрочная цель – определить, какие кишечные бактерии обеспечивают устойчивость к инфекции Clostridium difficile.”
После однократного приема клиндамицина исследователи «обнаружили, что мыши стали очень восприимчивыми к инфекции, у них резко снизился вес, а уровень смертности составил около 40 процентов», – говорит Памер. «Выжившие мыши продолжали заражаться C. difficile в течение 28 дней и имеет стойкое воспаление кишечника.”
Затем команда исследовала влияние клиндамицина на кишечные микробиаты путем выделения содержимого тонкой кишки и слепой кишки и использования «платформы глубинного секвенирования ДНК 454» для идентификации видов. «К нашему удивлению, примерно 87 процентов видов бактерий, которые присутствовали до лечения антибиотиками, не были обнаружены после введения клиндамицина, потеря разнообразия сохранялась в течение 28 дней этого исследования», – говорит Памер. За это время видовой состав бактерий сильно колебался.
Исследование демонстрирует, как применение платформ глубокого секвенирования для анализа сложных микробных популяций, таких как те, которые населяют кишечник человека, может привести к пониманию и, возможно, прогнозированию восприимчивости к инфекции, вызываемой бактериями с высокой устойчивостью к антибиотикам, такими как C. difficile или энтерококк, устойчивый к ванкомицину, – говорит Памер.
Исследование было в значительной степени поддержано Фондом Тоу, который предоставил грант для поддержки Центра Люсиль Кастори по микробам, воспалению и раку при Мемориальном онкологическом центре Слоуна-Кеттеринга.