Ученые deCODE Genetics и научные сотрудники из Исландии, Нидерландов, Испании, Дании, Германии, Швеции, США, Великобритании и Румынии сегодня сообщают об открытии варианта в последовательности генома человека, связанного с риском развития базальноклеточной карциномы. кожи (ОЦК), а также рак простаты и глиома, наиболее серьезная форма рака мозга. Исследование было проведено в сотрудничестве с Illumina, Inc., и опубликовано сегодня в онлайн-издании Nature Genetics.
Используя технологию секвенирования Illumina, ученые deCODE определили последовательности полных геномов 457 исландцев и идентифицировали 16 миллионов однонуклеотидных полиморфизмов (SNP). Благодаря сочетанию генотипирования SNP и вычислительных методов с использованием обширной исландской генеалогии, они смогли распространить эти 16 миллионов вариантов более чем у 40 000 исландцев для использования в этом исследовании.
Исследователи обнаружили однобуквенный вариант, расположенный в TP53, гене, который, как известно, играет центральную роль в биологии опухолей и в накоплении так называемых соматических мутаций во время развития рака у пациентов. Однако до сих пор люди, рожденные с дефектными копиями гена (варианты зародышевой линии), встречались крайне редко, только в семьях с синдромами предрасположенности к раку, синдромом Ли Фраумени (LFS) и синдромом Ли-Фраумени (LFL). Вариант, обнаруженный в настоящем исследовании, представляет собой необычный тип мутации, который, по-видимому, влияет на способ обработки матричной РНК гена; информационная РНК у пациентов с мутантным геном TP53, по-видимому, не имеет надлежащей терминации и полиаденилирования.
Это первое свидетельство варианта зародышевой линии в TP53, связанного с предрасположенностью к раку, помимо LFS и LFL. В то время как мутации, вызывающие синдромы LFS и LFL, очень редки (встречающиеся 1: 5) (от 000 до 1:20) (от 000 до 1: 000 рождений), вариант, описанный в этой статье, встречается примерно у 1 из 25 человек в Исландии, и с сопоставимой частотой у населения США и Великобритании.
"Эта мутация – одно из растущего числа открытий deCODE относительно низкочастотных вариантов последовательностей с большим эффектом," сказал Кари Стефанссон, генеральный директор deCODE и старший автор исследования. "Обнаружение таких вариантов стало возможным благодаря широте и качеству данных, которые предоставляет исландское население."
Доктор. Стефанссон подчеркнул, "Вместе с нашими сотрудниками, включая Illumina, мы расширим наши возможности, чтобы превратить это открытие в пользу пациентов и тех, кто подвержен риску рака."
BCC – наиболее распространенный вид рака у людей европейского происхождения. Воздействие солнца является основным фактором риска BCC, но генетическая предрасположенность также играет существенную роль. До сих пор не было известно никакой механистической причинно-следственной связи между такими разнообразными видами рака, как BCC, рак простаты, глиома и колоректальная аденома.