Исследователи определили четыре новых участка в геноме человека, связанные с болезнью Бехчета, болезненным и потенциально опасным состоянием, встречающимся преимущественно у людей, чьи предки жили по Шелковому пути. На протяжении почти 2000 лет торговцы использовали эту 4000-мильную сеть, связывающую Дальний Восток с Европой, для обмена товарами, культурой и, в случае болезни Шелкового пути, генами. Исследователи Национального института здравоохранения и их турецкие и японские сотрудники опубликовали свои выводы в январе. 6 августа 2013 г., продвинутый онлайн-выпуск журнала Nature Genetics.
Болезнь Бехчета (произносится как BET’-chets), названная в честь турецкого врача, описавшего ее в 1937 году, вызывается сложными генетическими факторами и факторами окружающей среды и вызывает воспаление кровеносных сосудов в различных частях тела. Общие симптомы включают болезненные язвы во рту и гениталиях, а также воспаление глаз, которое может привести к слепоте. В некоторых случаях это может быть опасным для жизни, поражая кровеносные сосуды головного мозга, легких и других жизненно важных органов. Примерно 1 из 250 человек в Турции страдает болезнью Бехчета; другие с этим заболеванием встречаются в основном в регионах вдоль Шелкового пути.
Считается, что генетические факторы играют роль в предрасположенности к болезни Бехчета, при этом область гена человеческого лейкоцитарного антигена (HLA) B-51 в геноме составляет около 20 процентов генетического риска заболевания. Исследователи знали об ассоциации HLA B-51 около 40 лет. Два года назад исследовательская группа определила ассоциации генов в двух других конкретных хромосомных участках, или локусах.
"Настоящее исследование представляет собой важный шаг вперед, поскольку оно резко расширяет спектр генетических локусов, связанных с болезнью Бехчета," сказал Дэн Кастнер, M.D., Ph.D., научный руководитель программы внутренних исследований в Национальном исследовательском институте генома человека и старший автор исследования. "Эти недавно обнаруженные генетические ассоциации обеспечивают связь между болезнью Бехчета и другими более распространенными заболеваниями и, таким образом, предлагают новые методы лечения болезни Бехчета. Кроме того, два недавно открытых гена обеспечивают интригующую связь между генами и микробами в нашей среде."
Исследователи провели полногеномное ассоциативное исследование (GWAS), в котором приняли участие 1209 турок, страдающих болезнью Бехчета, и 1278 здоровых турок – все жители страны. Они рассмотрели многие аспекты генома человека, называемые однонуклеотидными полиморфизмами (SNP), причем каждый SNP представляет собой различие в одном строительном блоке ДНК, называемом нуклеотидом. Затем исследователи сравнили различия SNP между людьми с заболеванием и без него.
Из почти 800000 SNP исследователи обнаружили и нанесли на карту небольшое количество, которые обнаруживаются у тех, у кого болезнь Бехчета, со значительно большей частотой, чем у тех, у кого нет болезни, что позволяет предположить, что тот или иной вариант поблизости способствует развитию болезни.
"Каждый из генетических факторов может вносить небольшой вклад в общий риск заболевания," сказала Элейн Ф. Реммерс, Ph.D., научный сотрудник отдела воспалительных заболеваний NHGRI и соавтор исследования. "Мы также выявляем их пути, которые играют важную роль в развитии воспалительных заболеваний."
Она отметила, что не все из 800 000 проанализированных вариантов генов были напрямую генотипированы. Генотипирование включает исследование ДНК человека в месте, где, как известно, происходят вариации. Вместо этого команда использовала стратегию вменения или предположения о существовании генотипов, которые стоит исследовать рядом с известными вариантами.
"Это сработало для нас очень хорошо," Доктор. Реммерс сказал. "Мы обнаружили, что наши предсказанные генотипы были довольно хорошими, и что ассоциации, которые мы обнаружили, были довольно похожими как для предсказанных, так и для экспериментально подтвержденных генотипов."
Уже известно, что каждый из четырех недавно идентифицированных участков гена играет роль в иммунной регуляции. Генетические ассоциации помогли классифицировать болезнь Бехчета с более распространенными воспалительными состояниями, такими как псориаз, воспалительное заболевание кишечника и форма спинального артрита, называемая анкилозирующим спондилитом.
Среди недавно выявленных регионов исследователи обнаружили:
"Мы невероятно рады этим последним открытиям," Доктор. Кастнер сказал. "В сочетании с нашими исследованиями два года назад текущие генетические данные убедительно свидетельствуют о причинной связи между болезнью Бехчета и такими заболеваниями, как анкилозирующий спондилит, псориаз и воспалительное заболевание кишечника. Это вселяет реальную надежду на то, что некоторые из методов лечения, которые оказались эффективными при этих других заболеваниях, окажутся полезными при болезни Бехчета, тем самым помогая облегчить страдания и предотвратить смертность."