Группа ученых, в том числе исследователи из Университета Шеффилда, сегодня (25 сентября 2020 г.) опубликовали свою оценку новой технологии быстрого тестирования на COVID-19, которая может расширить тип и масштаб доступных тестов.
LamPORE, новая диагностическая платформа для обнаружения SARS-CoV-2RNA, сочетает опосредованную петлей изотермическую амплификацию с секвенированием нанопор, что означает, что она может анализировать тысячи образцов в день на одном приборе.
Хотя результаты предварительные, результаты предполагают высокий уровень диагностической чувствительности LamPORE, что может означать расширение шкалы тестирования, которое может быть предложено в будущем, чтобы помочь контролировать пандемию SARS-CoV-2.
Сотрудничество между Университетом Шеффилда и коллегами из Public Health England Porton Down (PHE), Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust и Оксфордского университета, включая поддержку Оксфордского биомедицинского исследовательского центра NIHR, позволило оценить эффективность LamPORE в сравнении с RT-PCR. – наиболее часто используемый лабораторный тест на COVID-19.
Команда использовала РНК (рибонуклеиновая кислота, которая представляет собой полимерную молекулу, необходимую для различных биологических ролей в кодировании, декодировании, регуляции и экспрессии генов), извлеченная из двух типов образцов. Первоначально имитировали образцы слюны людей без инфекции, в которые было добавлено известное количество вируса, а затем мазки из носа и горла реальных пациентов с COVID-19, собранные во время плановой помощи в двух больницах Великобритании – больницах Оксфордского университета, NHS Foundation Trust и Учебные больницы Шеффилда Фонд NHS Foundation Trust.
Положительные клинические образцы поступали в основном от пациентов с симптоматической инфекцией, и среди них диагностическая чувствительность LamPORE составляла 99.1 процент (я.е. он был положительным в 226 из 228 проб, положительных при ОТ-ПЦР).
Среди отрицательных клинических образцов, в том числе 153 с обнаруженными другими респираторными патогенами, диагностическая специфичность LamPORE составляла 99.6 процентов (я.е. он был отрицательным в 278 из 279
образцы отрицательные при ОТ-ПЦР). Всего 1.4 процента образцов дали неопределенный результат при первом тестировании, а повторное тестирование LamPORE с тем же экстрактом РНК имело воспроизводимость 96.8 процентов.
Эти результаты показывают, что эффективность LamPORE аналогична ОТ-ПЦР для диагностики инфекции SARS-CoV-2 у пациентов с симптомами.
Доктор. Тушан де Сильва из факультета инфекций, иммунитета и сердечно-сосудистых заболеваний Шеффилдского университета сказал: "Это предварительные, но многообещающие данные, которые предполагают, что LamPORE имеет потенциал для расширения типа и масштаба тестирования SARS-CoV-2, которые могут быть предложены в будущем. Мы рады сотрудничать с сотрудниками Оксфорда и отдела общественного здравоохранения Англии, чтобы помочь оценить эту новую диагностическую платформу для SARS-CoV-2."
Доктор. Кариад Эванс, консультант-вирусолог в Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust и соавтор опубликованной оценки, сказала: "Мы рады внести свой вклад в эту важную оценку. Это обнадеживающие первые результаты, и мы гордимся тем, что поддержали Общественное здравоохранение Англии и наших академических партнеров в этом важном исследовании COVID-19."
Профессор Хелен МакШейн, директор NIHR Oxford BRC, сказала: "Это отличный пример того, как финансирование NIHR для поддержки академического и промышленного сотрудничества может привести к разработке новых инструментов, которые помогут нам контролировать пандемию SARS-CoV-2."
Доктор. Стив Пуллан из отдела общественного здравоохранения Англии, Портон-Даун, сказал: "Наши ранние данные указывают на то, что LamPORE является надежной альтернативой традиционной диагностике на основе ПЦР, которая может обеспечить дальнейшие возможности высокопроизводительного тестирования."