Геномные технологии входят в основную практику медицины

Клиническое секвенирование генома и экзома (CGES) когда-то считалось экзотикой, но все чаще используется клиническими генетиками и другими специалистами для диагностики редких, клинически нераспознаваемых или загадочных заболеваний, которые предположительно имеют генетическое происхождение. Несколько тысяч тестов CGES по всей стране уже заказаны для пациентов, и в ближайшие годы ожидаются еще тысячи. CGES быстро переходит из исследовательских лабораторий в клиническую медицинскую практику по всем специальностям.

Обзорная статья под названием, "Диагностический клинический геном и секвенирование экзома" опубликованный сегодня в выпуске журнала New England Journal of Medicine (NEJM) от 19 июня, обобщает технологии, лежащие в основе CGES, и предлагает понимание того, как клиницисты должны заказывать такое тестирование, интерпретировать результаты и сообщать результаты своим пациентам.

"Это переломный момент в истории медицины, поскольку мы начинаем интегрировать секвенирование генома в лечение пациентов," сказал Роберт С. Грин, доктор медицины, магистр здравоохранения, соавтор, медицинский генетик и содиректор Консультационной службы по личной геномике в Бригаме и женской больнице (BWH), клинической службы персонализированной геномной помощи. "Хотя в этой статье мы сосредоточены на использовании секвенирования в случаях, когда диагностика затруднена, последовательность – это только начало. Мы можем ожидать, что эти технологии помогут нам перейти от всего нашего подхода к медицине к более индивидуализированному и профилактическому уходу."

"Технологии, которые использовались в проекте «Геном человека», теперь преобразованы в практические инструменты, которые врачи могут использовать для диагностики и, надеюсь, лечения заболеваний у пациентов, которых они не могли лечить раньше, сказал Лесли Дж. Бизекер, доктор медицинских наук, Национальный исследовательский институт генома человека. "Он появился намного быстрее, быстрее развился и стал более полезным в клинической практике, чем я думаю, любой разумный человек мог бы предположить всего 10 лет назад. В то время я не думаю, что кто-то воспринял бы вас всерьез, если бы вы сказали, что в 2014 году десятки тысяч пациентов получат клиническое секвенирование генома и экзома."

Авторы согласны с тем, что врачи должны понимать, что секвенирование экзома не может ответить на все вопросы и подходит не для всех пациентов. Цель их статьи – описать, что нужно знать врачам, чтобы правильно их использовать. Например:

Хотя эти технологии иногда называют секвенированием всего генома или всего экзома, они не охватывают 100 процентов генома или экзома. Из-за способа сбора и сборки целевых последовательностей ДНК не всю ДНК можно секвенировать, и этот метод лучше всего подходит для обнаружения однонуклеотидных вариантов или изменений в последовательностях не более чем из 8-10 пар оснований. Он может не улавливать более длинные вариации или повторы последовательностей или длинные делеции, которые являются причиной некоторых генетических нарушений.

Наиболее многообещающими являются пациенты с редкими заболеваниями, которые, по всей видимости, являются результатом вариантов одного гена. Врачам следует изучить семейный анамнез – наличие и характер аналогичных расстройств у родственников – и провести обширный поиск литературы, прежде чем заказывать секвенирование экзома. Информированное согласие важно.

Секвенирование экзома не может поставить диагноз. В среднем около 25 процентов таких тестов выявляют вариант гена, вызывающий заболевание; большинство приходит с пустыми. Однако из-за пробелов в технологии отрицательный результат не обязательно исключает генетическую причину заболевания.

В большинстве случаев выявление генетической причины не приводит к излечению. Даже в этих случаях секвенирование экзома может быть полезным, поскольку оно может положить конец дорогостоящей, потенциально инвазивной и стрессовой диагностической одиссее.

Анализ результатов может дать случайные результаты – открытие варианта гена, не связанного с первичным заболеванием пациента, но способного вызвать заболевание и требующего медицинского наблюдения или лечения отдельного состояния.

Консультировать пациентов и их семьи о том, чего ожидать, важно, но сложно, потому что пациент может быть разочарован неубедительным результатом такого обширного и дорогостоящего теста.

Некоторые из уроков, извлеченных из этой статьи, являются результатом исследований в области геномной медицины, проводимых в BWH, таких как проект MedSeq, финансируемый Национальным институтом здравоохранения (NIH), возглавляемый Грин. Грин также является со-режиссером с Аланом Х. Беггс, доктор философии проекта BabySeq, финансируемого Национальным институтом здравоохранения, будет проводиться совместно в BWH и Бостонской детской больнице (BCH). Проекты MedSeq и BabySeq – это первые крупномасштабные рандомизированные испытания секвенирования у взрослых и новорожденных, которые помогают определить весь спектр преимуществ и рисков, связанных с секвенированием генома.

Похожие записи