Саский участвовал в упорядочивании генома, который является решающим трамплином к дальнейшим продвижениям понимания внутренних работ одного из самых сложных и хранивших заводов на планете.Будущие последствия исследования Саского в краткие сроки и длительные сроки и финансовые и целостные. Нагорный хлопок, который составляет больше чем 90 процентов культурного хлопка во всем мире и оказывает глобальное влияние на экономику $500 миллиардов, является главным источником возобновляемых текстильных волокон.
Последовательность генома, представленная в научном журнале Nature Biotechnology, обеспечит ноу-хау, чтобы спроектировать превосходящие линии, которые будут одевать, кормить и питать когда-либо расширяющееся народонаселение.«С точки зрения открытия – наличие прочной основы, чтобы начать измерять генетическое разнообразие и как гены организованы – это – переломный момент», сказал Саский, директор Геномики Клемсона и Вычислительной Лаборатории Биологии. «С картой генома и генетически разнообразным населением, Вы можете показать биологию и подпись ДНК, лежащую в основе хлопкового развития волокна. Тогда Вы можете использовать эту информацию, чтобы породить хлопковые линии с передовым удлинением волокна и прочностью волокна, которые крайне важны для промышленности.
Этот первый проект последовательности генома – прочная основа для того, чтобы открыть тайны хлопка».Нагорный хлопок появился больше чем миллион лет назад, когда две отдельных разновидности скрестились, создав завод, у которого есть многократные геномы. В отличие от людей, у которых есть два набора хромосом (от матери и отца), Нагорный хлопковый геном формируется с четырьмя наборами, добавляя многократные слои сложности для ученых, таких как Саский.
«Вы можете только вообразить проблемы смешивания, которые могут произойти, когда у Вас есть многократные геномы», сказал Саский. «Я интересуюсь процессом, лежащим в основе polyploidization и как лучшее понимание этой сложности может быть усилено, чтобы породить лучший хлопок».Находящийся в США консорциум Саского, который включает Брайана Шеффлера из американского Министерства сельского хозяйства, Дэвида Стелли из Техасского университета A&M, Дона Джонса из Cotton Inc. и Джеффри Чена из Техасского университета в Остине, поехал в Нанкинский Университет Сельского хозяйства в восточном Китае. Там они работали с командой во главе с преподавателями Тяньчжэнь Чжаном и Жуйцян Ли, чтобы собрать геном проекта.«Китай – самая большая производящая хлопок страна в мире», сказал Саский, начальное исследование которого в области проекта началось больше чем четыре года назад. «В конце мы были успешны в том, чтобы готовить почву для использования информации о ДНК, чтобы сообщить и принести пользу заводчикам».
Нагорный хлопок – одни из основополагающих товарных зерновых культур Южной Каролины. Это было выращено со времени американской Революции, и это остается основным урожаем по сей день. Это – также ведущий сельскохозяйственный экспорт Южной Каролины.
Хлопковым заводчикам бросают вызов выпустить новые разновидности, подходящие для подобных засухе условий и высоких почв солености, и которые также лучше способны сопротивляться постоянным угрозам от вредителей и болезней.«Методы и подход, который Саский и его сотрудники применяют, чтобы расшифровать сложный хлопковый геном, окажут глубокое влияние на способ, которым хлопок улучшен посредством размножения», сказал Стивен Крезович, Председатель Установки для коксования Генетики и директор Института Клемсона Переводной Геномики. «Это понимание также продвинет наше понимание генетики полиплоидии, которая так распространена в хлебных злаках».Хлопковый геном, который производит прядомые волокна, чрезвычайно сложен из-за присутствия многократных геномов, явление, которое происходит приблизительно в 80 процентах всех видов растений.
«Саский и его коллеги разработали инновационные стратегии, чтобы анализировать хлопковый геном, используя сравнительную геномику, генетику, вычислительную биологию и высокоэффективное вычисление», сказал Кресович. «Результаты этой работы окажут прямое влияние в открытии новых черт в хлопке и связанных разновидностях и будут готовить почву для ускоренного агрономического улучшения. Поскольку будущее разворачивается, Южная Каролина, конечно, будет крупным благотворителем».